Лаборатория РЕГУЛЯЦИИ ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ В РАЗВИТИИ

 

Заведующий лаборатории - ШИДЛОВСКИЙ Юлий Валерьевич, д.б.н., yul.biogen@gmail.com

Научный руководитель лаборатории - Шедл Пол, pschedl@princeton.edu

 

 

Сотрудники лаборатории регуляции экспрессии генов в развитии:

МАКСИМЕНКО Оксана Геннадьевна - старший научный сотрудник, к.б.н. mog@genebiology.ru

МОГИЛА Владислав Анатольевич - старший научный сотрудник, к.б.н. mog.ila@mail.ru

ЛЕБЕДЕВА Любовь Александровна - старший научный сотрудник, к.б.н. ll78@yandex.ru

ЛАВРОВА Ольга Игоревна – научный сотрудник, к.б.н. derevo888@yahoo.com

ЯКОВЛЕВ Константин Владимирович – научный сотрудник, к.б.н. konstantin.yakov@gmail.com

КУРБИДАЕВА Амина Султановна - младший научный сотрудник, к.б.н. amina.kur@gmail.com

ТИХОНОВ Максим Васильевич - младший научный сотрудник, к.б.н. mtih@rambler.ru

РЯБИЧКО Сергей Сергеевич – младший научный сотрудник s.ryabichko@gmail.com

ЕЛИЗАРЬЕВ Павел Владимирович – младший научный сотрудник pavel-elizaryev@ya.ru

КАЧАЕВ Заур Мозырович – младший научный сотрудник, k-z-m@mail.ru

ШАПОШНИКОВ Александр Владимирович - младший научный сотрудник, аспирант shaldr23@mail.com

ГИЛЬМУТДИНОВ Рудольф Артурович - младший научный сотрудник, аспирант rudolf.gilmutdinov@mail.ru

ЗОЛОТАРЕВ Николай Александрович - старший лаборант-исследователь, аспирант nickolay.zolotarev@yandex.ru

ОСАДЧИЙ Игорь Сергеевич – аспирант

ФЕДОТОВА Анна Александровна - лаборант-исследователь, аспирант annafedotova@list.ru

АБДРАХМАНОВ Алибек - студент МГУ им. М.В.Ломоносова

ЖЕЛУДКЕВИЧ Анна - студент МГУ им. М.В.Ломоносова

КЕРЧЕВ Виктор – студент Первого МГМУ им. И.М. Сеченова

ГАШИМОВ Гусейн – студент Первого МГМУ им. И.М. Сеченова

КЛАДКОВАЯ Елена Викторовна – помощник руководителя lena_klad@mail.ru

Tel.: 7(499)135-99-24
Fax: 7(499)135-41-05

Вакансии: студент, аспирант, научный сотрудник

 

ИСТОРИЯ

Лаборатория создана в 2013 г. для выполнения работ по договору с Министерством Образования и Науки РФ № 14.B25.31.0022 от 26 июня 2013 (грант для проведения научных исследований под руководством ведущих ученых). Научный руководитель лаборатории - профессор Университета Принстона Пол Шедл.

 

ОБЩЕЕ НАПРАВЛЕНИЕ ИССЛЕДОВАНИЙ

В лаборатории исследуются молекулярные основы регуляции функционирования генов в процессе развития организма.

Развитие многоклеточного организма представляет собой чрезвычайно сложный процесс, который требует скоординированного действия множества участников на молекулярном уровне. Развитие организма задается первоначально пространственной структурой яйцеклетки и затем - точно регулируемой в пространстве и во времени активностью генов. Активация различных групп генов в различных клетках определяет их дальнейшую судьбу. Выяснение молекулярных основ развития многоклеточного организма является одной из важнейших задач современной молекулярной биологии. Эти исследования дают нам ключ к пониманию фундаментальных молекулярных процессов, определяющих развитие высокоупорядоченных организмов.

Основные этапы процесса экспрессии гена. Активность гена контролируется регуляторными элементами, энхансерами (Enh) и инсуляторами (Ins). Инсуляторы формируют домен активной транскрипции на хроматиновой фибрилле. Энхансер привлекает активаторы, которые обеспечивают последующее привлечение коактиваторов на промотор (Pr), модификацию и ремоделирование структуры хроматина и запуск активной транскрипции. Активность гена также определяется его локализацией внутри ядра. РНК-полимераза II синтезирует мРНК, которая формирует рибонуклеопротеиновые частицы (мРНП). мРНП созревают в нуклеоплазме и экспортируются в цитоплазму. Состав мРНП изменяется в цитоплазме, они транспортируются внутри клетки и транслируются.

Исследования в нашей лаборатории связаны с выяснением молекулярных механизмов, регулирующих экспрессию генов. Экспрессия генов - фундаментальный процесс, лежащий в основе жизнедеятельности организма. Он включает в себя ряд последовательных молекулярных стадий: подготовка матрицы хроматина, транскрипция ДНК, созревание мРНК и формирование рибонуклеопротеиновых частиц, их внутриклеточный транспорт и трансляция на рибосомах. Каждая из указанных стадий контролируется определенным набором факторов - молекулярных машин, которые обычно представлены мультисубъединичными белковыми комплексами. Взаимодействие и согласованное привлечение различных факторов обеспечивает координацию отдельных этапов в единый процесс и точный контроль активности генов.

Контроль экспрессии генов осуществляется на различных стадиях: регулируется инициация и элонгация транскрипции, эффективность синтеза и процессинга мРНК, ее экспорт и стабильность, а также трансляция мРНК. До сих пор не все участники этих процессов описаны, также еще недостаточно изучены механизмы их действия и координации совместной работы. Поскольку экспрессия гена может контролироваться различными способами, мы подходим к изучению этого вопроса на нескольких различных уровнях.

Первый из них связан со структурной организацией генома. На этом уровне мы изучаем особый класс регуляторных элементов, называемых инсуляторами или пограничными элементами. Эти элементы сочетают структурную и регуляторную активности. Они ответственны за организацию ДНК в составе эукариотических хромосом, а также играют ключевую роль в регуляции транскрипции. Нашей задачей является поиск белков и белковых комплексов, которые связываются с инсуляторами.

Второй уровень - транскрипционный. Чаще всего экспрессия генов контролируется на уровне транскрипции. У высших эукариот на этом этапе задействовано несколько тысяч белков и их комплексов. Они формируют большой аппарат транскрипции, обеспечивающий точный контроль активности генов. Мы исследуем молекулярные механизмы действия нескольких важных компонентов этого аппарата.

Помимо этого, мы изучаем биогенез рибонуклеопротеиновых частиц. мРНК после синтеза проходит целый ряд стадий, включая созревание в ядре и экспорт через ядерную мембрану. Все процессы, связанные с мРНК, контролируются набором факторов, которые последовательно связываются с этой молекулой. мРНК существует в клетке в составе рибонуклеопротеиновых комплексов (РНП). Состав мРНП меняется в процессе созревания мРНК: различные факторы динамично входят и выходят из состава РНП-комплексов.

Особенный интерес для нас представляет локализация синтеза белков внутри клетки. Пространственная локализация белков в клетке влияет на множество различных биологических процессов, важных для развития многоклеточных организмов. Мы исследуем роль локализации мРНК и регуляции локальной трансляции в установлении полярности клеток и органов.

Наконец, мы исследуем роль различных факторов в специализации стволовых клеток зародышевого пути.

В целом, наши исследования направлены на выяснение молекулярных основ структурной организации и функционирования эукариотического генома. Эти вопросы являются одними из важнейших для современной молекулярной биологии. Они открывают путь к пониманию жизнедеятельности как отдельной клетки, так и целого организма в процессе онтогенеза. В то же время эти знания имеют практическое значение в медицине (диагностика и лечение ряда заболеваний, связанных с изменением профиля экспрессии генов), биотехнологии (направленный контроль работы генов).

Основной объект, на котором проводятся эксперименты в лаборатории, - Drosophila melanogaster.

 

ТЕКУЩИЕ НАПРАВЛЕНИЯ РАБОТЫ

 

Молекулярные основы действия инсуляторов

Типы активности инсуляторов. A: Энхансер-блокирующая активность. Функция инсулятора зависит от его окружения; он может блокировать активность энхансера (или сайленсера), если находится между ним и его промотором. B: Барьерная активность. Инсуляторы, ограничивающие ген с обеих сторон, защищают его от распространения гетерохроматина. En - энхансер, Ins - инсулятор. (Chetverina D et al. 2013. Bioessays. 36(2):163-72)

Геномы эукариот организованы в виде последовательности структурно и функционально автономных доменов, содержащих индивидуальные гены и контролирующие их регуляторные элементы, кластеры совместно экспрессирующихся генов или групп генов, у которых такие элементы являются общими. Данная форма организации защищает гены одного домена от воздействия регуляторных элементов соседних доменов и является принципиально важной для обеспечения экспрессии эукариотических генов в определенных типах клеток, на определенных стадиях развития организма или в нужной точке клеточного цикла. Такое разделение генома на обособленные домены осуществляется специальным классом регуляторных элементов, называемых инсуляторами или пограничными элементами. Инсуляторы и инсулятор-подобные элементы были обнаружены в самых разных организмах, начиная от одноклеточных эукариот, таких как дрожжи и Plasmodium falciparum, до многоклеточных животных, таких как дрозофила, лягушка, мышь и человек. Первоначально инсуляторы были обнаружены на основе их способности блокировать взаимодействие между энхансером и его промотором, находясь между ними. Кроме того, многие из известных инсуляторов обладают еще одним типом активности, - барьерной, которая позволяет им защищать гены от влияния гетерохроматина. Блокирующая и барьерная активность необходимы для предотвращения влияния регуляторных элементов PRE (PRE - Polycomb response elements). Регуляторные элементы PRE связываются с белками группы polycomb (PcG) и вызывают сайленсинг расположенных рядом генов.

Активность инсуляторов хорошо описана в литературе. Однако о механизмах, ответственных за указанные типы активности, известно немного. С целью более глубокого понимания того, как функционируют данные структурные элементы, ведется работа по выявлению белков и белковых комплексов, взаимодействующих с инсуляторами.

Для решения этой задачи используется несколько методов. Один из наиболее продуктивных - хроматографическая очистка белковых комплексов.

Предполагаемая молекулярная модель энхансер-блокирующей активности инсуляторов (топологическая модель петлевых доменов). Пограничные элементы делят хромосому на набор топологически независимых петель. Энхансеры/сайленсеры (En) могут связываться со своими целевыми регуляторными участками путем скольжения ДНК внутри петли. Гены топологически изолированы от регуляторных элементов в соседних петлях. В данной модели пограничные элементы (B) способны активно блокировать взаимодействие между регуляторными элементами. Концевые точки петлевых доменов могут быть связаны с ядерным матриксом, хромосомным скаффолдом или инсуляторными тельцами. (Gohl D et al. 2011., Genetics 187(3):731-48)

 

Исследование функций коактиваторов транскрипции РНК-полимеразы II

Транскрипция генов РНК-полимеразой II инициируется при участии широкого спектра различных факторов. Общая схема активации транскрипции состоит в следующем. Ген-специфические активаторы связываются с регуляторными последовательностями ДНК и привлекают коактиваторы транскрипции. Последние выполняют две функции: подготовку матрицы хроматина и привлечение общих факторов транскрипции и РНК-полимеразы, которые формируют преинициаторный комплекс на промоторе.

В лаборатории изучается механизм действия фактора SAYP, хроматин-ремоделирующий комплекс Brahma и общий фактор транскрипции TFIID.

Транскрипционный коактиватор SAYP взаимодействует с общим фактором транскрипции TFIID и хроматин-ремоделирующим фактором Brahma, в результате чего формируется мультибелковый суперкомплекс Brahma. Под действием определенных внешних стимулов активатор транскрипции связывается с регуляторным участком конкретного гена и привлекает BTFly на ген. BTFly может смещать нуклеосому на промоторе и, таким образом, открывать доступ к промотору общим факторам транскрипции, что, в конечном итоге, запускает транскрипцию гена (Vorobyeva NE et al. 2009. PNAS USA. 106(27):11049-54).

 

Участие факторов транскрипции в сигнальных путях организма и контроле онтогенеза

Экспрессия генов контролируется сигналами, поступающими в клетку извне. Распознавание и передача поступающих стимулов осуществляется многочисленными сигнальными путями. Важный вопрос - изучение молекулярных механизмов, обеспечивающих связь сигнальных путей с аппаратом транскрипции. Конечным звеном сигнальных каскадов часто является специфический фактор транскрипции, контролирующий определенный круг генов-мишеней. Мы изучаем детали молекулярных событий, происходящих при активации генов-мишеней.

Результаты хроматин-иммунопреципитации, показывающие привлечение различных факторов транскрипции на промоторы генов-мишеней Jak/Stat-сигнального пути (Panov VV etal. 2012. Nucleic Acids Res 40(6): 2445-53)

 

Активация генов, кодирующих белки теплового шока

Гены теплового шока - группа генов, обеспечивающих нормальное функционирование клетки в условиях воздействиях высокой температуры. Изучение их началось в 1962 г., когда были обнаружены пуфы теплового шока на политенных хромосомах дрозофилы. Эти гены присутствуют у представителей самых различных таксонов (от простейших до человека) и давно стали удобной моделью для изучения регуляции экспрессии генов. У дрозофилы выделяют гены hsp100, hsp90, hsp70, hsp60 и малые hsp. Активация генов теплового шока имеет специфические особенности, такие как пауза РНК-полимеразы на промоторе, формирование транскрипционного компартмента, привлечение ограниченного круга общих факторов транскрипции. Гены теплового шока - удобная модель для изучения процесса транскрипции.

Привлечение РНК-полимеразы II (справа) на локусы 87А и 87С при тепловом шоке. Слева - окрашивание DAPI.

 

Молекулярные основы привлечения комплекса дозовой компенсации

Дозовая компенсация - важное явление в развитии организма. У самцов дрозофилы происходит увеличение транскрипции единственной Х-хромосомы с целью выравнивания экспрессии Х-сцепленных генов у обоих полов. Специфичный для самцов комплекс белков и некодирующей РНК, называемый MSL (male-specific-lethal), функционирует как активатор, удваивающий транскрипцию X-сцепленных генов у самцов дрозофилы. В настоящее время недостаточно изучен вопрос о специфических белках, обеспечивающих привлечение MSL на Х-хромосому у самцов. Проводится поиск факторов, опосредующих данное воздействие.

MSL комплекс. Строение, указаны каталитические активности, присущие субъединицам MLE, MOF, JIL1 (Gilfillan G.D. et al. 2004 FEBS Letters, 567, 8-14).

 

Роль мРНК-связывающих белков в развитии

Регуляция трансляции материнской мРНК в яйцеклетках и эмбрионах определяет многие аспекты развития организма. Так, развитие передней части тела ранних эмбрионов дрозофилы определяется локализацией материнской мРНК гена bicoid, которая закладывается в ооцит в процессе его созревания. мРНК bicoid синтезируется в трофоцитах, а затем транспортируется в ооцит и локализуется в его передней части. После оплодотворения мРНК транслируется, в результате чего формируется градиент белка bicoid, который, в свою очередь, контролирует экспрессию зиготических генов, определяющих развитие передней части тела у развивающегося эмбриона.

Локализация мРНК определяется как специальными сигналами в самих мРНК, так и РНК-связывающими белками, распознающими эти сигналы. РНК-белковые комплексы взаимодействуют с аппаратом клетки, который направляет мРНК к определенному внутриклеточному отделу, где она в конечном итоге транслируется.

Мы изучаем функции трех белков, участвующих в данном процессе: orb, orb2 и paip2.

Функция белка paip2. Paip2, связываясь с фактором PABP, нарушает взаимодействие факторов, стимулирующих трансляцию мРНК в цитоплазме (McLaughlin EA, Hime GR. 2011. Asian J Androl 13(1):122-4).

 

Поддержание статуса первичных половых клеток

Стволовые клетки зародышевого пути (GSC), находящиеся в гонадах взрослых особей, являются тотипотентными предшественниками всех типов клеток у следующего поколения. Уникальные специфичные свойства клеток зародышевого пути у взрослой особи могут быть прослежены до этапа раннего эмбриона, когда формируются их предшественники - первичные половые клетки (PGC). Последние развиваются по пути, отличающемуся от соседних соматических клеток. Вопросы о том, как первоначально происходит специализация первичных половых клеток и как закладывается и поддерживается их уникальная идентичность до связывания со специализированными соматическими клетками ниши в гонадах, имеют большое значение в исследованиях стволовых клеток и репродуктивной биологии. Мы исследуем формирование, специализацию и поддержание статуса первичных половых клеток, используя эмбрион дрозофилы в качестве модельной системы.

Первичные половые клетки обладают особыми свойствами, которые отличают их от соматических клеток эмбриона. У дрозофилы, как и у большинства других животных, кроме млекопитающих, эти свойства определяются материнскими детерминантами, которые являются частью первичных половых клеток или выделяются с ними. Первичные половые клетки формируются в эмбрионах дрозофилы на стадии синцитиальной бластодермы, когда ядра, мигрирующие к поверхности эмбриона, входят в цитоплазму заднего полюса. Помимо преждевременной целлюляризации, первичные половые клетки отличаются от ядер соседних соматических клеток по двум важным признакам. Во-первых, в то время как ядра соматических клеток продолжают делиться, недавно образовавшиеся первичные половые клетки дрозофилы делятся один или два раза, а затем в них происходит арест клеточного цикла в фазе G2. Во-вторых, при переходе к средней бластуле в ядрах соматических клеток начинает повышаться транскрипция генов РНК-полимеразой II, тогда как в первичных половых клетках транскрипция снижается.

Снижение транскрипции в первичных половых клетках у дрозофилы контролируется тремя материнскими генами: pgc, nanos и gcl. Мы исследуем функции этих белков и других факторов, с которыми они взаимодействуют.

Уменьшение количества и нарушение локализации полярных стволовых клеток (окрашены) у эмбрионов при мутации гена shifted (B) по сравнению с нормальными эмбрионами (А). (Deshpande G et al. 2013 PLoSGenet. 9(9):e1003720)

 

Визуализация геномных процессов

В настоящее время в рамках ФЦП «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2014 - 2020 годы» лаборатория участвует в реализации совместного проекта с Институтом интегративной геномики Льюиса Сиглера Принстонского Университета (США) по разработке технологии микроскопической визуализации геномных процессов. Последние достижения в микроскопии позволили преодолеть дифракционный предел (барьер Аббе), который устанавливал ограничение разрешения в 200 нм. Методы микроскопии сверх-высокого разрешения, в особенности такие как STED, PALM и STORM, теперь могут быть использованы для визуализации объектов и процессов, которые ранее были недоступны.

Регуляция генов эукариот тесно связана с трехмерной организацией хроматина. Образование хроматиновых петель позволяет энхансерам и сайленсерам вступить в физический контакт с генами-мишенями и, в то же время, предотвращает нежелательное воздействие на другие гены. Модель регуляции генов энхансерами/сайленсерами была разработана на основе анализа методами ChIP и 3С. Однако эти методы имеют один недостаток: они предоставляют лишь общую оценку состояния биологической системы, основанную на усреднении и статистической оценке полученных данных, в то время, как описываемые с их помощью процессы динамичны. Мы разрабатываем технологию визуализации геномных процессов на основе микроскопа с двух-фотонной активацией флуоресценции, дополнив его модулем LLSM (lattice light sheet microscopy). В процессе разработки мы решим 2 основные задачи: 1) разработаем метод микроскопии высокого разрешения, способного осуществлять визуализацию геномных процессов в эмбрионах дрозофилы в течение длительного времени и 2) оптимизируем методы мечения in vivo для наблюдения хромосомной динамики и экспрессии генов.

Структура репортерной конструкции: eve stripe 2 участок ДНК (-1.7 т.п.н., +50 п.н.) встроен перед 24 повторами последовательности MS2 и репортерного гена yellow. MCP-GFP белок связывающийся с MS2 присутствует в неоплодотворенной яйцеклетке и раннем эмбрионе. Конфокальное изображение эмбриона на 14 цикле деления трансгенной мухи, несущей eve>MS2 трансген. Мечение проведено гибридизацией in situ с использованием зондов для репортерного гена yellow (плазмидный трансген) и эндогенной РНК eve в одном эмбрионе (Bothmaa JP et al. 2014. PNAS USA. 111(29):10598-603).

 

ПРИЗЫ И НАГРАДЫ СОТРУДНИКОВ

Шидловский Ю.В.

  • Медаль РАН с премией для молодых ученых (2005)
  • Лауреат XV конкурса Европейской Академии для молодых ученых России (2008)
  • Лауреат Главной Премии Международной академической издательской компании «Наука Интерпериодика» за лучшую публикацию в журналах РАН (2008)
  • Персональные гранты Президента РФ для молодых кандидатов наук (2005, 2007, 2009), персональные гранты FEBS и EMBO (2005 – 2011), персональный грант Центра Медицинских Исследований в России (2009 – 2011), персональный грант молодым ученым в области молекулярной и клеточной биологии фонда «Династия» (2010 – 2011).

Максименко О.Г.

  • Национальная стипендия Л'Ореаль - ЮНЕСКО "Для женщин в науке" (2010)
  • Медаль РАН с премией для молодых ученых (2010)
  • Лауреат конкурса Европейской Академии для молодых ученых России (2012)

Лебедева Л.А.

  • Медаль РАН с премией для молодых ученых (2005).

Рябичко С.С.

  • Лауреат молодежного инновационного конкурса по программе «УМНИК» (2009).
  • Лауреат программы «Идея-1000» (2010)
  • Лауреат конкурса «Евгений Завойский» (DAAD) (2011)
  • Лауреат конкурса Бизнес Успех-2012

Шапошников А.В.

  • Лауреат молодежного инновационного конкурса по программе «УМНИК» (2013).

Золотарев Н.А.

  • Лауреат молодежного инновационного конкурса по программе "УМНИК" (2012).

 

КОЛЛАБОРАТОРЫ

Работы ведутся в сотрудничестве с Лабораторией регуляции генетических процессов, Лабораторией молекулярной генетики Drosophila и Отделом регуляции транскрипции и динамики хроматина ИБГ РАН.

Зарубежные коллабораторы:

 

КОНФЕРЕНЦИИ

На базе Лаборатории в 2015 году была проведена международная конференция для молодых ученых «Молекулярный контроль экспрессии генов».

В 2016 планируется проведение второй международной конференции для молодых ученых. Подробнее...

 

СПИСОК ПУБЛИКАЦИЙ

2013

  1. Costa A., Pazman C., Sinsimer K.S., Wong L.C., McLeod I., Yates J 3rd, Haynes S, Schedl P. (2013) Rasputin functions as a positive regulator of orb in Drosophila oogenesis. PLoS One. 8: e72864. PubMed
  2. Deshpande G., Zhou K., Wan J.Y., Friedrich J., Jourjine N., Smith D., Schedl P. (2013) The hedgehog Pathway Gene shifted Functions together with the hmgcr-Dependent Isoprenoid Biosynthetic Pathway to Orchestrate Germ Cell Migration. PLoS Genet. 9: e1003720. PubMed
  3. Zolotarev N., Stakhov V., Kyrchanova O. and Maksimenko O. (2013) Identification of new Drosophila proteins involved in insulator functions. FEBS Journal.280, supplement 1: 12.
  4. Maksimenko O., Kyrchanova O., Bonchuk A., Stakhov V., Georgiev P. (2013) The role of Eny2/Sus1 protein in realization of barrier activity of Drosophila dCTCF-dependent insulators. FEBS Journal.280, supplement 1: 13.
  5. Шапошников А.В., Крындушкин А.С., Николенко Ю.В., Панов В.В., Набирочкина Е.Н., Лебедева Л.А., Шидловский Ю.В. (2013) Активирование сигнальногопути JAK/STAT в культуре клеток S2 Drosophila melanogaster. Молекулярная биология. 47: 486-491. PubMed
  6. Шапошников А.В., Комарьков И.Ф., Лебедева Л.А., Шидловский Ю.В. (2013) Строение сигнального пути JAK/STAT и его взаимосвязь с аппаратом с аппаратом транскрипции. Молекулярная биология. 47: 388-397. PubMed
  7. Лебедева Л.А., Шапошников А.В., Панов В.В., Шидловский Ю.В. (2013) Биологические функции сигнального пути JAK/STAT в организме дрозофилы. Генетика. 49: 1245-1250. PubMed

2014

  1. Aoki T., Wolle D., Ben Noon E.P., Dai Q., Lai E.C., Schedl P. (2014) Bi-functional cross-linking reagents efficiently capture protein-DNA complexes in Drosophila embryos. Fly (Austin). 8(1):43-51. PubMed
  2. Deshpande G., Willis E., Chatterjee S., Fernandez R., Dias K., Schedl P. (2014) BMP Signaling and the Maintenance of Primordial Germ Cell Identity in Drosophila Embryos. PLoS One. 9(2):e88847. PubMed
  3. Chetverina D., Aoki T, Erokhin M., Georgiev P., Schedl P. (2014) Making connections: Insulators organize eukaryotic chromosomes into independent cis-regulatory networks. Bioessays. 36(2):163-72. PubMed
  4. Maksimenko O., Kyrchanova O., Bonchuk A., Stakhov V., Parshikov A., Georgiev P. (2014) Highly conserved ENY2/Sus1 protein binds to Drosophila CTCF and is required for barrier activity. Epigenetics. 9(9):1261-70. PubMed
  5. Xu S., Tyagi S., Schedl P. (2014) Spermatid cyst polarization in Drosophila depends upon apkc and the CPEB family translational regulator orb2. PLoS Genet. 10(5):e1004380. PubMed
  6. Maksimenko O., Georgiev P. (2014) Mechanisms and proteins involved in long-distance interactions. Front Genet. 5:28. PubMed

2015

  1. Barr J., Gordon D., Schedl P., Deshpande G. (2015) Xenotransplantation exposes the etiology of azoospermia factor (AZF) induced male sterility. Bioessays. 37(3):278-83. PubMed
  2. Maksimenko O., Bartkuhn M., Stakhov V., Herold M., Zolotarev N., Jox T., Buxa M.K., Kirsch R., Bonchuk A., Fedotova A., Kyrchanova O., Renkawitz R., Georgiev P. (2015) Two new insulator proteins, Pita and ZIPIC, target CP190 to chromatin. Genome Res. 25(1):89-99. PubMed
  3. Wolle D., Cleard F., Aoki T., Deshpande G., Schedl P., Karch F. (2015) Functional requirements for Fab-7 boundary activity in the Bithorax Complex. Mol Cell Biol. 35(21):3739-52 PubMed
  4. Bonchuk A., Maksimenko O., Kyrchanova O., Ivlieva T., Mogila V., Deshpande G., Wolle D., Schedl P., Georgiev P. (2015) Functional role of dimerization and CP190 interacting domains of CTCF protein in Drosophila melanogaster. BMC Biol. 13:63. PubMed
  5. Kyrchanova O., Mogila V., Wolle D., Magbanua J.P., White R., Georgiev P., Schedl P. The boundary paradox in the Bithorax complex. Mech Dev. 138(2): 122–132 PubMed
  6. Erokhin M., Elizar'ev P., Parshikov A., Schedl P., Georgiev P., Chetverina D. (2015) Transcriptional read-through is not sufficient to induce an epigenetic switch in the silencing activity of Polycomb response elements. Proc Natl Acad Sci USA. 112(48):14930-5 PubMed
  7. Zolotarev N., Maksimenko O., Bonchuk A., Kyrchanova O., Ciglar L., Girardot C., Furlong E., Georgiev P. (2015) Drosophila Opbp protein regulates divergently-paired genes with different expression levels. FEBS Journal. 282, Supplement 1: 70.

2016

  1. Deshpande G, Nouri A, Schedl P. (2016) Wnt Signaling in Sexual Dimorphism. Genetics. 202(2):661-73 PubMed
  2. Barr J, Yakovlev KV, Shidlovskii Y, Schedl P. (2016) Establishing and maintaining cell polarity with mRNA localization in Drosophila. Bioessays. 38(3):244-53 PubMed
  3. Fujioka M, Mistry H, Schedl P, Jaynes JB. (2016) Determinants of Chromosome Architecture: Insulator Pairing in cis and in trans. PLoS Genet. 12(2):e1005889. PubMed
  4. Deshpande G, Manry D, Jourjine N, Mogila V, Mozes H, Bialistoky T, Gerlitz O, Schedl P. (2016) Role of the ABC transporter Mdr49 in Hedgehog signaling and germ cell migration. Development. 143(12):2111-20 PubMed
  5. Kyrchanova O, Mogila V, Wolle D, Deshpande G, Parshikov A, Cleard F, Karch F, Schedl P, Georgiev P. (2016) Functional Dissection of the Blocking and Bypass Activities of the Fab-8 Boundary in the Drosophila Bithorax Complex. PLoS Genet. 12(7):e1006188. PubMed

RU   EN

Поиск

на сайте

в Яндекс

Полезные ссылки

ФАНО

РАН

Совет по науке и образованию

Минобрнауки

Российский Фонд Фундаментальных Исследований

Российский Научный Фонд

eLIBRARY.RU

Классическая и молекулярная биология

Наука и технологии России

Постнаука

N+1

Научная Россия

Элементы

Биомолекула

Мой геном

Blastim

Biohab

Телеканал Наука 2.0

Очевидное-невероятное

Фестиваль науки

Трансгенные животные в фарминдустрии

Практическая молекулярная биология

Biocompare

Подписка на новости

Институт биологии гена РАН